En un mundo paralelo, donde las almas humanas toman la forma de compañeros del genero animal, una niña se coloca entre el fin de la libre voluntad y el inicio de una nueva era. Lyra Belacqua solo tiene 12 años, pero incluso ella sabe que hacer lo que te dicen en lugar de hacer lo que sientes que esta bien puede tener resultados muy diferentes. Huerfana rebelde que vive como una reclusa en Jordan College en la ciudad de Oxford, Lyra pertenece a un mundo que es uno de muchos mundos paralelos: mundos no vistos, dimensiones intangibles donde la humanidad se desarrolla con sutiles diferencias. Pero Lyra nunca esta sola en el suyo. Ella va a todas partes con su daimonion, un pequeño animal, siempre cambiante, llamado Pantalaimon. En otros mundos, el alma reside dentro del cuerpo de las personas, oculta y en silencio. En el suyo, el daimonion es un compañero de por vida. Pero el mundo de Lyra esta cambiando. El supremo cuerpo de gobierno llamado el Magisterium esta apretando sus garras contra la poblacion. Su oscura maniobra ha dado lugar a una erupcion de secuestros de niños por una fuerza misteriosa llamada los Gobblers. Los rumores que corren entre los navegantes Gipcios (Giptanos), que han perdido a muchos de los suyos a manos de los secuestradores, es que se estan llevando los niños a una estacion experimental en el norte para someterlos a experimentos innombrables. Cuando el mejor amigo de Lyra, Roger, desaparece, ella jura viajar hasta el fin del mundo para rescatarlo. Lord Asriel, el gallardo y aspero tio explorador de Lyra esta al mismo tiempo organizando un viaje a esa region para intentar controlar el poder de un misterioso fenomeno llamado Dust que el piensa reside donde las luces del norte se cruzan sobre el helado Circulo Polar Artico. Desesperada por acompañar a su tio, pero siendo rechazada su peticion, Lyra recibe una segunda oportunidad cuando la universidad recibe la visita de la Sra. Coulter, una seductora cientifica y conocedora del mundo. La Sra. Coulter saca a Lyra de su vida en Jordan, prometiendole grandes aventuras en Londres y mas alla. Antes de irse, Lyra recibe un desconcertante dispositivo antiguo llamado el aletiometro, que se dice le proporciona al portador toda la verdad, siempre que logre descubrir como hacer uso de el.